: Onderzoek naar de moord op een medewerker van het Louvre onthult veel geheimen die verband houden met Maria Magdalena.
Laat in het Louvre wordt de curator Jacques Sauniere vermoord, wiens lichaam wordt misvormd door vreemde tekens. De politie is van mening dat het slachtoffer zo zelfmoord heeft gepleegd. Zijn moordenaar, Silas, belt een bepaalde leraar en meldt dat de vier mensen die hem dezelfde informatie hadden verteld voordat hij stierf, waren verwijderd. Een bepaalde broederschap heeft de hoeksteen gecreëerd waarop het is gecodeerd met tekenen, waar het geheim van deze broederschap wordt bewaard. Alle vier de doden lieten zien dat de kaart in de Parijse kerk van Saint-Sulpice ligt. De leraar heeft deze kaart dringend nodig.
De politie zoekt hulp bij Robert Langdon, hoogleraar religieuze symboliek aan de Harvard University. Sauniere, die Langdon nooit kende, maakte een afspraak met de professor die de dag ervoor in Parijs was aangekomen.
Bisschop Aringarosa, vader-voorzitter van de Opus Dei-broederschap, vliegt van New York naar Rome. Onlangs heeft een speciale groep de broederschap in de gaten gehouden, aangezien sommige van haar leden in ongepaste handelingen zijn gezien, maar de broederschap staat onder auspiciën van het Vaticaan. Onlangs zijn enkele leden van de broederschap aangevallen. Aringarosa ontvangt het nieuws dat Silas de hoeksteen heeft gevonden.
Langdon wordt naar het Louvre gebracht op de plaats delict. Volgens de politie was Sauniere in zijn kantoor toen hij werd aangevallen. Hij rende naar de galerij, zette het alarm aan en scheurde de foto van de muur. De ingang van de galerij werd geblokkeerd door een dalend rooster en de moordenaar schoot er doorheen op de curator. Sauniere kroop een behoorlijk lange afstand en stierf. De politie vond hem naakt, liggend op zijn rug met uitgestrekte armen en benen. In het midden van de buik was een vijfpuntige ster - pentakel getekend. In het donker waren naast het lijk paarse letters en cijfers zichtbaar. De moordenaar is spoorloos verdwenen.
De zus van de kerk van Saint Sulpice Sandrine ontmoet de vertegenwoordiger van het Opus Dei die in Parijs is aangekomen.
Langdon probeert te ontcijferen wat er is geschreven en komt tot de conclusie dat Sauniere met zijn pose het beroemde schilderij van Leonardo da Vinci "The Vitruvian Man" heeft gekopieerd.
De hoofdonderzoeker, kapitein Bezu Fache, stuurt de beelden met borden naar de afdeling cryptografie en de cryptograaf Sophie Nieuve van de gerechtelijke politie arriveert op de plaats delict. Ze laat Langdon weten dat hij in gevaar is.
Aringarosa ontmoet Silas, aan wie hij ooit zijn leven heeft gered, en met leraar.
Sophie vertelt Fache dat een reeks cijfers een Fibonacci-reeks is. Nu het moment is verbeterd, ontmoet ze privé met Langdon en vertelt hem dat hij de eerste verdachte is van de moord, dus werd er een speciaal volgbaken in zijn zak gestopt. Naast de geheime tekens die bij het lichaam waren geschreven, was er een inscriptie die Fache had gewist: Sauniere vroeg Langdon te zoeken. De inscriptie was niet bedoeld voor de politie, maar voor haar, aangezien zij de kleindochter is van Sauniere.
Sophie werd om vier uur als wees achtergelaten. Haar ouders, grootmoeder en jongere broer stierven bij een auto-ongeluk en haar grootvader voedde het meisje op. Tien jaar geleden, toen ze zonder waarschuwing naar huis terugkeerde, vond ze haar grootvader in het gezelschap van vreemde mensen die een voorwerp aanbaden en vreemde riten uitvoeren. Sophie heeft het uitgemaakt. Sindsdien hebben ze elkaar niet meer gezien, hoewel haar grootvader haar heeft gevraagd om af te spreken.
Met hulp van Sophie weet Langdon te ontsnappen uit het Louvre. Na het zorgvuldig te hebben gelezen, concludeert Langdon dat dit een anagram is van de woorden "Leonardo da Vinci Mona Lisa", en dat de Fibonacci-reeks een cijfer is.
Sophie blijft alleen achter in het Louvre. Ze wil 'Mona Lisa' vinden en ontdekken wat voor mysterieuze boodschap haar grootvader heeft achtergelaten.
Silas komt naar de kerk van Saint-Sulpice. Hij vraagt zuster Sandrine hem met rust te laten om te bidden. Ondergedoken houdt zuster Sandrine hem in de gaten.
Sophie komt naar de plaats delict.Langdon rent niet weg, maar keert terug naar haar. Denkend concludeert hij dat de inscriptie naast de overledene was gecodeerd met een symbool van een geheim genootschap dat Sophie ooit bij haar grootvader had gezien. Na het glas in het schilderij "Mona Lisa" te hebben onderzocht, zien ze de inscriptie in bloed - een van de fundamentele principes van de broederschap.
Sophie onderzoekt een ander schilderij van Leonardo da Vinci 'Madonna in the Grotto'. Daar vindt ze een ongebruikelijk gevormde sleutel, die ze ooit in de jeugd van haar grootvader zag, en die een doos met veel geheimen zou moeten openen. Aan de sleutel zien ze het adres.
Langdon wordt gearresteerd door de veiligheidsagent van het Louvre, maar Sophie redt hem.
Silas, die denkt dat hij alleen in de kerk is, haalt een bijbel uit de cache om erachter te komen waar de hoeksteen is. Zuster Sandrine belt de aangesloten leden van de broederschap en komt erachter dat ze allemaal zijn vermoord.
Sophie en Langdon lopen weg van de politie. Langdon vertelt over de Priorij van Zion-broederschap, wiens zegel de sleutel markeert. De Tempeliers overhandigden aan de broederschap belangrijke geheime documenten die van Jeruzalem naar Europa waren gebracht, waarin ze het hebben over de Heilige Graal.
Niets gevonden, vermoordt Silas zus Sandrine.
Aringarosa ontvangt een groot bedrag van het Vaticaan.
Het adres op de sleutel is een Zwitserse bank. Sophie en Langdon vinden een kluis, maar kennen het rekeningnummer niet. De president van het bankkantoor, Andre, weet dat ze worden verdacht van moord, hun beelden zijn al verspreid door Interpol. Sophie vertelt hem wat er is gebeurd. De politie die hen volgt, arriveert bij de bank. Bern stemt ermee in om te helpen verbergen, hij heeft geen problemen op de bank nodig en Sauniere was zijn vriend. Langdon herinnert zich het opschrift naast het lichaam van de overledene - dit is het rekeningnummer.
In de kluis staat een doos met het symbool van de Priorij van Zion op het deksel. Berne neemt de doos mee en haalt de voortvluchtigen onopgemerkt uit de bank.
Silas bekeert zich tegen Master dat hij de taak niet heeft voltooid, maar hij stelt hem gerust: hij weet aan wie Sauniere de informatie heeft doorgegeven.
In de kist zit een cryptex, een cilinder met schijven. Cryptex heeft Leonardo da Vinci uitgevonden, maar Sauniere vond het leuk om zulke dingen uit hout te snijden. Na erover na te hebben gedacht en van Sophie te hebben geleerd over de rite die ze in haar jeugd zag, concludeert Langdon dat Sauniere een van de hoogste leden van de samenleving was die het geheim was toevertrouwd, en de cryptex geeft aan waar de Graal zich bevindt. Er zouden nog drie mensen moeten zijn die geheim zijn, blijkbaar voelde Sauniere enig gevaar als hij het geheim aan zijn kleindochter en hem wilde toevertrouwen.
Berne hoort op de radio dat Sophie en Langdon ervan worden beschuldigd nog drie mensen te hebben vermoord en eist dat ze weggeven wat Sauniere hem heeft toevertrouwd. Sophie en Langdon vluchten weg en laten Bern alleen achter in het bos. Langdon realiseert zich dat een verrader de broederschap is binnengegaan. Hij besluit zich tot de uitmuntende wetenschapper Lew Teabing te wenden, die de Graal bestudeert. Teabing is geïnteresseerd in Critpex en geeft ze niet aan de politie.
Na met Langdon naar Sophie te hebben geluisterd, laat Teabing hen de afbeelding zien van het "Laatste Avondmaal" van Leonardo da Vinci. Elk van de dertien deelnemers aan het avondmaal heeft zijn eigen beker, maar de Bijbel en andere legendes geloven dat de Heilige Graal hier verscheen. Teabing is van mening dat de Graal geen object is, maar een man en een vrouw, aangezien het symbool van het vrouwelijke een vat is. Deze vrouw is afgebeeld op de foto en zij is Maria Magdalena.
Volgens verschillende documenten en de oude Dode Zee-rollen was er een romantische relatie tussen Jezus en Maria Magdalena, ze waren echtgenoten. Bloed in de graal is het kind van Jezus gedragen door Maria Magdalena. De kerk verborg dit feit en verklaarde dat Maria Magdalena een hoer was, wat niet waar was.
Om het kind te redden, vluchtte Mary naar Frankrijk en beviel van een meisje Sarah. Documenten over het leven van Jezus, Maria en Sarah werden verborgen en gevonden door de Tempeliers. De zoektocht naar de Heilige Graal is de zoektocht naar het graf van Maria Magdalena.
De clan van Jezus ontwikkelde zich, fuseerde met de clan van de Franse koningen en stichtte Parijs.
Teabing's bediende Remy informeert de huisbaas dat Langdon en Sophie door de politie worden gezocht.Zodat Teabing ze niet aan de autoriteiten zou overhandigen, laat Langdon hem de cryptex zien. Dit wordt gezien door Silas die onder zijn raam sluipt. Ondertussen rijdt de politie naar het huis van Teabing.
Bij nader inzien komen Teabing, Sophie en Langdon tot de conclusie dat Sauniere het geheim van Sophie's broederschap heeft doorgegeven, aangezien de anderen die haar kenden, werden vermoord. De moordenaar moet door de kerk gestuurd worden.
Teabing bestudeert de cryptex, terwijl Langdon in de andere kamer de kist onderzoekt. Daarin vindt hij een stuk hout met een inscriptie in een voor hem onbekende taal, maar hier slaat Silas hem in zijn achterhoofd. Sophas en Teabing bedreigend met een pistool, eist Silas om hem de cryptex te geven. Teabing gooit een pistool van hem af.
De politie stormt het huis van Teabing binnen, maar Teabing, Remy, Sophie en Landox nemen Silas en slagen erin te ontsnappen. Langdon is niet duidelijk hoe Silas ze kon vinden.
Teabing biedt iedereen de mogelijkheid om met zijn vliegtuig naar Engeland te vliegen. Na over de cryptex te hebben nagedacht, besluiten de voortvluchtigen dat het nodig is om het graf van de Tempeliers te vinden, en het gecodeerde woord is Sofia. In de cryptex is nog een cryptex, samen met een briefje waarin staat dat je het graf van de ridder gevonden door de paus in Londen moet vinden en de bal daar naartoe moet nemen.
Bij het horen van het nieuws beseft Aringarosa waar hij Silas bij heeft betrokken en besluit hij naar Londen te vliegen.
Na de Engelse politie te hebben misleid, gaan Teabing, samen met Langdon, Sophie, Remy en Silas naar het graf van de ridder in de kerk, waar de Tempeliers begraven liggen. Terwijl Teabing met Sophie en Langdon in de kerk zijn, maakt Remy, die voor Leraar werkt en verwacht een groot bedrag te ontvangen, Silas vrij. Silas stormt de kerk binnen met een pistool en eist dat hij de hoeksteen krijgt. Langdon dreigt de cryptex te breken. Dan legt Remy het pistool op de tempel van Teabing en Langdon geeft de cryptex terug. Remy haalt Teabing weg en laat Sophie los met Langdon.
In het huis van Teabing overvallen de politie. Het blijkt dat zijn bediende Remy ooit betrokken was bij kleine diefstallen. Ook detecteert de politie een luistersysteem voor mensen.
Sophie meldt zich bij de politie over de ontvoering van Teabing. Kapitein Fache praat met haar vanuit Frankrijk. Hij verontschuldigt zich voor de beschuldigingen en wil de voortvluchtigen ontmoeten.
De leraar belt Silas en vraagt Remy om hem een steen te brengen in de Opus Dei-residentie.
In het Royal Library Research Center ontmoet Sophie Langdon met bibliothecaris Pamela Getty.
Bij het verlaten van Remy met de bijbehorende Teabing in de auto, arriveert Silas bij de residentie. Een leraar komt naar de auto, die niemand eerder heeft gezien. Hij vermoordt Remy door de kritiek te nemen.
Pamela bestudeert de documenten en komt tot de conclusie dat de ridder Isaac Newton is, de Grote Meester van de Priorij van Zion, die door de kerk werd vervloekt. Newton werd begraven in Westminster Abbey door de filosoof Alexander Pop, wiens naam en het woord "Papa" hetzelfde zijn gespeld.
Silas wordt gearresteerd in residentie Opus Dei. Tijdens de detentie verzet hij zich en verwondt hij bisschop Arangaros per ongeluk.
Sophie en Langdon maken zich zorgen over Teabing en komen naar het graf van Newton. Ze worden gezien door een verborgen meester. Sophie en Langdon zien een inscriptie op een grafsteen die vertelt waar Teabing zich bevindt.
Op de aangegeven plaats vinden ze het pistool van Teabing dat op hen is gericht. Dit is de leraar die de moord op Sauniere, de familie Sophie en andere mensen organiseerde, zodat niemand het geheim van de Graal zou kennen. Teabing voerde een gesprek met Remy en Silas en hield hen voor de gek. Nu wil hij het geheim van cryptex overnemen.
Silas sleept een gewonde bisschop mee om geholpen te worden. Een paar maanden geleden werd Aringaros gesuggereerd dat het Opus Dei uit de voogdij van het Vaticaan zou komen. Toen de bisschop weigerde, werd hij door een zekere leraar geroepen en aangeboden om te helpen bij het zoeken naar een heilig relikwie. De bisschop betreurt het dat hij Silas heeft bevolen de meester te gehoorzamen.
Teabing en Langdon proberen elkaar te slim af te zijn en bedenken wat de bal op het graf betekent: een appel. Maar dan arresteert de politie Teabing.
Silas sterft aan zijn verwondingen.
Langdon en Sophie komen naar Schotland, naar de kerk, die de laatste vermelding in de cryptex aangeeft.Daar ontmoeten ze een vrouw die precies dezelfde doos heeft. De vrouw blijkt de grootmoeder van Sophie te zijn, die jarenlang onder een andere naam leeft. Sophie's jongere broer woont bij haar oma. Oma en broer reden toen niet in de auto en moesten zich daarna verstoppen.
Sophie heeft een gezin gekregen en Langdon moet vertrekken. Ze spreken af elkaar binnenkort in Florence te ontmoeten.
